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Jul 11, 2023

Bruker lança espectrômetro de massa timsTOF Ultra com sensibilidade transformativa, 300 Hz PASEF MS/MS e VistaScan™ para diagnóstica aprimorada

Publicado: 05 de junho de 2023 timsTOF Ultra Mais avanços

Publicado: 05 de junho de 2023

timsTOF Ultra Avanços Quantitativos Espaciais e de Célula Única 4D-Proteômica e 4D-Lipidomics™, Imunopeptidomica, PTM e Análise de Interações Proteína-Proteína - com Velocidade e Robustez

HOUSTON--(BUSINESS WIRE)--Na 71ª reunião da ASMS, a Bruker Corporation (Nasdaq: BRKR) anunciou a sensibilidade transformadora na plataforma timsTOF 4D-Proteomics com o lançamento do novo espectrômetro de massa timsTOF Ultra. Ele incorpora uma nova fonte de íons Captive Spray Ionization (CSI) Ultra com capilar maior e fluxo de gás de vórtice otimizado, uma nova célula XR TIMS (separação de mobilidade de íons presos) de 4ª geração e digitalizador de 14 bits. O timsTOF Ultra pode identificar mais de 55K peptídeos que mapeiam em 5.000 grupos de proteínas no nível de célula única de carga de proteína de 0,125 ng, a 1% de FDR e mais de 4.800 grupos de proteínas quantificados em CVs de <20%. Essa sensibilidade inovadora e desempenho de quantificação abaixo do nível de carga de proteína de 1 ng definem um novo padrão. Sensibilidade incomparável, com a robustez comprovada da plataforma timsTOF e com ciclo de trabalho PASEF agora até 300 Hz para MS/MS, oferece melhorias significativas de desempenho para quantidades de amostras ultrabaixas, incluindo proteômica de célula única imparcial e lipidômica de célula única , proteômica espacial imparcial, imunopeptidomica, fosfoproteômica, análise de PTM e estudos de interação proteína-proteína (PPI).

Este comunicado de imprensa apresenta multimídia. Veja o comunicado completo aqui: https://www.businesswire.com/news/home/20230605005326/en/

Espectrômetro de massa timsTOF Ultra (Foto: Business Wire)

O Dr. Fabian Coscia, líder do Grupo de Proteômica Espacial no Centro Max Delbruck, em Berlim, Alemanha, disse: "O fluxo de trabalho dia-PASEF de sensibilidade de célula única no timsTOF Ultra elevou nossa pesquisa de proteômica de tecidos de baixa entrada a um novo nível. Usando um gradiente LC de nanofluxo de 20 minutos combinado com o método dia-PASEF otimizado de Bruker (janela 3x8), podemos agora quantificar reprodutivelmente 1.500 - 2.000 proteínas de tecido FFPE de fígado de camundongo microdissecado a laser de apenas 1.500 µm2, regiões correspondentes a aproximadamente 1- 2 hepatócitos."

Esses avanços do timsTOF Ultra foram alcançados sem comprometer a excelente robustez para proteômica de alto rendimento, por exemplo, em 50 amostras por dia (SPD), ou mesmo até 398 SPD, nem a maior confiança de identificação de <1% de peptídeo e <1% FDRs de proteínas (taxas de descoberta falsa), evitando a reatividade cruzada observada com métodos de reconhecimento imunológico direcionados.

O Professor Dr. Karl Mechtler, Chefe de Proteômica no Centro de Inovação do Instituto de Pesquisa para Patologia Molecular (IMP), Instituto Gregor Mendel (GMI) e Instituto de Biotecnologia Molecular da Academia Austríaca de Ciências (IMBA), acrescentou: "Para Para entender verdadeiramente os mecanismos celulares e as doenças, é crucial diferenciar entre os vários tipos de células. Embora a análise de célula única tenha mudado o jogo, enfrentamos obstáculos para maximizar seu potencial de rendimento e grupos de proteínas que podem ser analisados. Faria sentido biológico para detectar 6.000 ou mais proteínas em um experimento de célula única. O timsTOF Ultra superou essas barreiras, permitindo-nos explorar o proteoma de células individuais com velocidade e sensibilidade inigualáveis. Graças ao timsTOF Ultra, a análise de célula única atingiu novos patamares , e estou animado para ver onde esse avanço nos levará a seguir."

A Bruker também apresenta o software VistaScan para sincronizar a rampa TIMS com a varredura quadrupolo para se beneficiar ainda mais das informações de mobilidade de íons em escala. Essa sofisticada rampa dinâmica dinâmica suporta o novo modo midia-PASEF, introduzido por Stefan Tenzer (doi.org/10.1101/2023.01.30.526204).

O Dr. Stefan Tenzer, Professor de Proteômica Quantitativa e Chefe do MS Core Facility, Johannes Gutenberg University Mainz, comentou: "Nosso laboratório se concentra em métodos para proteômica quantitativa que requerem maior sensibilidade e maior extração de informações. Junto com Bruker, desenvolvemos o novo informação máxima dia (midia) modo de aquisição de varredura PASEF que oferece sensibilidade de aquisição independente de dados (dia), enquanto transforma dados em espectros semelhantes a aquisição dependente de dados (dda). "